Στην αίθουσα Β εκτίθεται η μικρή γλυπτοθήκη του Μουσείου, με τμήματα ανάγλυφων αρχιτεκτονικών μελών βυζαντινής περιόδου, καθώς και δύο παλαιοχριστιανικές επιτύμβιες στήλες και ανάγλυφη πλάκα ελληνιστικής περιόδου.
Ανάγλυφες επιτάφιες πλάκες όψιμης μεταβυζαντινής περιόδου και οικόσημα εκτίθενται και στα δύο κλιμακοστάσια του Μουσείου.
