Μπορεί το Αρχαιολογικό Μουσείο Ιωαννίνων να μην πήρε το πρώτο βραβείο στο European Museum Forum για το Ευρωπαϊκό Μουσείο 2012, αλλά πήρε πολλούς επαίνους για τη λειτουργία και το σχεδιασμό του.

Το πρώτο βραβείο πήρε τελικά το νεοσύστατο Μουσείο Madinat al-Zahra, στην Ανδαλουσία της Ισπανίας, το οποίο περιλαμβάνει τον αρχαιολογικό χώρο της μουσουλμανικής πρωτεύουσας του 10ου αιώνα. Το Αρχαιολογικό Μουσείο Ιωαννίνων πέρασε όμως στην τελική επιλογή των 31 ιδρυμάτων που πληρούσαν τις αυστηρές προδιαγραφές του EMF. Οι κριτές του διαγωνισμού επαίνεσαν ιδιαίτερα: την πρόσφατη επανέκθεση στο ΑΜΙ, στο πλαίσιο του Γ′ ΚΠΣ, την καινοτόμο και πρωτοποριακή μουσειολογική πρακτική, τις πολιτιστικές εκδοχές της Ηπείρου, οι οποίες στην επανέκθεση παρουσιάζονται ως πτυχές των κατοίκων από τα προϊστορικά στα υστερορωμαϊκά χρόνια και τις προκλήσεις για ανοιχτό διάλογο των επισκεπτών με επεισόδια της ιστορίας και της αρχαιολογίας.

Ακόμα, εκτιμήθηκε ιδιαίτερα η δραστηριότητα του μουσείου με τη φιλοξενία συνεδρίων, εκπαιδευτικών προγραμμάτων κ.ά., αλλά και η ασθητική αρτιότητα του κτιρίου και η αύξηση της επισκεψιμότητάς του. Στην εκδήλωση παρέστησαν ο Κώστας Σουέρεφ, Προϊστάμενος της ΙΒ′ ΕΠΚΑ, και η Ελένη Κοτζαμποπούλου, αναπληρώτρια προϊσταμένη του Αρχαιολογικού Ινστιτούτου Ηπειρωτικών Σπουδών. Η παρουσία του ΑΜΙ στο EMF ήταν η επίσημη εκπροσώπηση του υπουργείου Πολιτισμού και μαζί με το μουσείο «Νίκος Καζαντζάκης» προέβαλαν διεθνώς τη σύγχρονη και ριζοσπαστική μουσειακή πραγματικότητα της Ελλάδας.

Την υποψηφιότητα και τη συμμετοχή του ΑΜΙ στη συνάντηση του Πεναφιέλ της Πορτογαλίας, υποστήριξαν υλικά και ηθικά το υπουργείο Πολιτισμού, η Γενική Διεύθυνση Αρχαιοτήτων και Πολιτιστικής Κληρονομιάς, το Αρχαιολογικό Ινστιτούτο Ηπειρωτικών Σπουδών, η Εταιρεία των Φίλων του ΑΜΙ, τα ελληνικά ΜΜΕ και η τοπική κοινωνία των Ιωαννίνων. Η επιτροπή του EMF μάλιστα, πρότεινε τα Γιάννενα για τη φιλοξενία της επόμενης ετήσιας συνάντησης.